1941 január 5-én látta meg a napvilágot Tokióban. Édesapja Katsuji Miyazaki volt, aki a második világháború alatt a bátyja tulajdonában lévő Miyazaki Airplane gyárat vezette. A kis Miyazaki természetesen sokszor megfordult a munkahelyén és rengeteg alkalommal rajzolt repülőket, nem meglepő, hogy lelkesedni kezdett a repülésért, amely számos alkotásában visszatérő elem volt. Mondhatni szárnyra kapott a fantáziája.
Szülei több alkalommal költöztek, három éves volt, amikor kénytelenek voltak elhagyni Tokiónak azt a részét, ahol éltek. 9 éves volt, amikor hazaköltözhettek, ekkor íratták be a Toyotama Gimnáziumba. Miyazaki ekkor már mangaíróként képzelte el jövőjét. A gimi harmadik évében látta Taiki Yabushita animéjét, a Hakujadent, az első színes egészestés animációs film nagy hatással volt rá, ekkor határozta el, hogy inkább animációs filmeket szeretne csinálni. Olvasd tovább